Show SIM4 / tBLASTn alignment result

PARAMETERS:
Query Sequence ID: NM_007304.1
Subject Sequence ID: ENSG00000012048
Subject Sequence type: 2


seq1 = /RAID/mart2/Splice/public_html/fasta/rna.fa/NM_00/NM_007304.1, 3796 bp
seq2 = /RAID/mart2/Splice/web_temp/fasta/ENSG00000012048 (ENSG00000012048), 81091 bp

>gi|6552318|ref|NM_007304.1| Homo sapiens breast cancer 1, early onset (BRCA1), transcript variant BRCA1-delta11b, mRNA
>ENSG00000012048

(complement)

1-122  (1-121)   95% ->
123-221  (1277-1375)   100% ->
222-275  (9613-9666)   100% ->
276-353  (18859-18936)   100% ->
354-442  (20436-20524)   100% ->
443-582  (21131-21270)   100% ->
583-688  (25512-25617)   100% ->
689-734  (28103-28148)   100% ->
735-811  (29470-29546)   100% ->
812-928  (30532-30648)   98% ->
929-1017  (34360-34448)   100% ->
1018-1189  (42817-42988)   98% ->
1190-1313  (48781-48904)   100% ->
1314-1504  (50871-51061)   100% ->
1505-1815  (54154-54464)   99% ->
1816-1903  (57697-57784)   100% ->
1904-1981  (61441-61518)   100% ->
1982-2022  (62019-62059)   100% ->
2023-2106  (68257-68340)   100% ->
2107-2161  (74275-74329)   100% ->
2162-2235  (76198-76271)   100% ->
2236-2296  (77689-77749)   100% ->
2297-3796  (79590-81091)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AAAACTGCGACTGCGCGGCGTGAGCTCGCTGAGACTTCCTGGACCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |
      1 AAAACTGCGACTGCGCGGCGTGAGCTCGCTGAGACTTCCTGGACGGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGCTGTGGGGTTTCTCAGATAACTGGGCCCCTGCGCTCAGGAGGCCT
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     51 C AGGCTGTGGGGTTTCTCAGATAACTGGGCCCCTGCGCTCAGGAGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCCTCTGCTCTGGGTAAAG         TTCATTGGAACAGAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
    100 TCACCCTCTGCTCTGGGTAAAGGTA...AAGTTCATTGGAACAGAAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGATTTATCTGCTCTTCGCGTTGAAGAAGTACAAAATGTCATTAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1296 ATGGATTTATCTGCTCTTCGCGTTGAAGAAGTACAAAATGTCATTAATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATGCAGAAAATCTTAGAGTGTCCCATCTG         TCTGGAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
   1346 TATGCAGAAAATCTTAGAGTGTCCCATCTGGTA...TAGTCTGGAGTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAAGGAACCTGTCTCCACAAAGTGTGACCACATATTTTGCAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
   9624 TCAAGGAACCTGTCTCCACAAAGTGTGACCACATATTTTGCAAGTA...T

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    276   ATTTTGCATGCTGAAACTTCTCAACCAGAAGAAAGGGCCTTCACAGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  18857 AGATTTTGCATGCTGAAACTTCTCAACCAGAAGAAAGGGCCTTCACAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCCTTTATGTAAGAATGATATAACCAAAAG         GAGCCTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  18907 TCCTTTATGTAAGAATGATATAACCAAAAGGTA...CAGGAGCCTACAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAAGTACGAGATTTAGTCAACTTGTTGAAGAGCTATTGAAAATCATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20447 AAAGTACGAGATTTAGTCAACTTGTTGAAGAGCTATTGAAAATCATTTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCTTTTCAGCTTGACACAGGTTTGGAGT         ATGCAAACAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  20497 GCTTTTCAGCTTGACACAGGTTTGGAGTGTA...CAGATGCAAACAGCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TAATTTTGCAAAAAAGGAAAATAACTCTCCTGAACATCTAAAAGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21144 TAATTTTGCAAAAAAGGAAAATAACTCTCCTGAACATCTAAAAGATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTTCTATCATCCAAAGTATGGGCTACAGAAACCGTGCCAAAAGACTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21194 TTTCTATCATCCAAAGTATGGGCTACAGAAACCGTGCCAAAAGACTTCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAGAGTGAACCCGAAAATCCTTCCTTG         CAGGAAACCAGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  21244 CAGAGTGAACCCGAAAATCCTTCCTTGGTA...TAGCAGGAAACCAGTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CAGTGTCCAACTCTCTAACCTTGGAACTGTGAGAACTCTGAGGACAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25526 CAGTGTCCAACTCTCTAACCTTGGAACTGTGAGAACTCTGAGGACAAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGCGGATACAACCTCAAAAGACGTCTGTCTACATTGAATTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
  25576 AGCGGATACAACCTCAAAAGACGTCTGTCTACATTGAATTGGGTA...TA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    689  GATCTGATTCTTCTGAAGATACCGTTAATAAGGCAACTTATTGCAG   
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
  28102 GGATCTGATTCTTCTGAAGATACCGTTAATAAGGCAACTTATTGCAGGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    735       TGTGGGAGATCAAGAATTGTTACAAATCACCCCTCAAGGAACCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  28152 ...TAGTGTGGGAGATCAAGAATTGTTACAAATCACCCCTCAAGGAACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GGGATGAAATCAGTTTGGATTCTGCAAAAAAGG         CTGCTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  29514 GGGATGAAATCAGTTTGGATTCTGCAAAAAAGGGTA...CAGCTGCTTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GAATTTTCTGAGACGGATGTAACAAATACTGAACATCGTCAACCCAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  30540 GAATTTTCTGAGACGGATGTAACAAATACTGAACATCATCAACCCAGTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TAATGATTTGAACACCACTGAGAAGCGTGTAGCTGAGAGGCATCCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
  30590 TAATGATTTGAACACCACTGAGAAGCGTGCAGCTGAGAGGCATCCAGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGTATCAGG         GTGAAGCAGCATCTGGGTGTGAGAGTGAAACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
  30640 AGTATCAGGGTA...AAGGTGAAGCAGCATCTGGGTGTGAGAGTGAAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 AGCGTCTCTGAAGACTGCTCAGGGCTATCCTCTCAGAGTGACATTTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34392 AGCGTCTCTGAAGACTGCTCAGGGCTATCCTCTCAGAGTGACATTTTAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CACTCAG         CAGAGGGATACCATGCAACATAACCTGATAAAGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34442 CACTCAGGTA...AAGCAGAGGGATACCATGCAACATAACCTGATAAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TCCAGCAGGAAATGGCTGAACTAGAAGCTGTGTTAGAACAGCATGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  42851 TCCAGCAGGAAATGGCTGAACTAGAAGCTGTGTTAGAACAGCATGGGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CAGCCTCCTAACAGCTACCCTTCCATCATAAGTGACTCCTCTGCCCTTGA
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
  42901 CAGCCTTCTAACAGCTACCCTTCCATCATAAGTGACTCTTCTGCCCTTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GGACCTGCGAAATCCAGAACAAAGCACATCAGAAAAAG         TAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
  42951 GGACCTGCGAAATCCAGAACAAAGCACATCAGAAAAAGGTG...CAGTAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TAACTTCACAGAAAAGTAGTGAATACCCTATAAGCCAGAATCCAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  48784 TAACTTCACAGAAAAGTAGTGAATACCCTATAAGCCAGAATCCAGAAGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CTTTCTGCTGACAAGTTTGAGGTGTCTGCAGATAGTTCTACCAGTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  48834 CTTTCTGCTGACAAGTTTGAGGTGTCTGCAGATAGTTCTACCAGTAAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TAAAGAACCAGGAGTGGAAAG         GTCATCCCCTTCTAAATGCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  48884 TAAAGAACCAGGAGTGGAAAGGTA...TAGGTCATCCCCTTCTAAATGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 CATCATTAGATGATAGGTGGTACATGCACAGTTGCTCTGGGAGTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  50891 CATCATTAGATGATAGGTGGTACATGCACAGTTGCTCTGGGAGTCTTCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 AATAGAAACTACCCATCTCAAGAGGAGCTCATTAAGGTTGTTGATGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  50941 AATAGAAACTACCCATCTCAAGAGGAGCTCATTAAGGTTGTTGATGTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GGAGCAACAGCTGGAAGAGTCTGGGCCACACGATTTGACGGAAACATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  50991 GGAGCAACAGCTGGAAGAGTCTGGGCCACACGATTTGACGGAAACATCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 ACTTGCCAAGGCAAGATCTAG         AGGGAACCCCTTACCTGGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  51041 ACTTGCCAAGGCAAGATCTAGGTA...CAGAGGGAACCCCTTACCTGGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 TCTGGAATCAGCCTCTTCTCTGATGACCCTGAATCTGATCCTTCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54174 TCTGGAATCAGCCTCTTCTCTGATGACCCTGAATCTGATCCTTCTGAAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CAGAGCCCCAGAGTCAGCTCGTGTTGGCAACATACCATCTTCAACCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54224 CAGAGCCCCAGAGTCAGCTCGTGTTGGCAACATACCATCTTCAACCTCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CATTGAAAGTTCCCCAATTGAAAGTTGCAGAATCTGCCCAGGGTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  54274 CATTGAAAGTTCCCCAATTGAAAGTTGCAGAATCTGCCCAGAGTCCAGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GCTGCTCATACTACTGATACTGCTGGGTATAATGCAATGGAAGAAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54324 GCTGCTCATACTACTGATACTGCTGGGTATAATGCAATGGAAGAAAGTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GAGCAGGGAGAAGCCAGAATTGACAGCTTCAACAGAAAGGGTCAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54374 GAGCAGGGAGAAGCCAGAATTGACAGCTTCAACAGAAAGGGTCAACAAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 GAATGTCCATGGTGGTGTCTGGCCTGACCCCAGAAGAATTT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
  54424 GAATGTCCATGGTGGTGTCTGGCCTGACCCCAGAAGAATTTGTG...CAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 ATGCTCGTGTACAAGTTTGCCAGAAAACACCACATCACTTTAACTAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  57697 ATGCTCGTGTACAAGTTTGCCAGAAAACACCACATCACTTTAACTAATCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 AATTACTGAAGAGACTACTCATGTTGTTATGAAAACAG         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
  57747 AATTACTGAAGAGACTACTCATGTTGTTATGAAAACAGGTA...CAGATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CTGAGTTTGTGTGTGAACGGACACTGAAATATTTTCTAGGAATTGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  61444 CTGAGTTTGTGTGTGAACGGACACTGAAATATTTTCTAGGAATTGCGGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GGAAAATGGGTAGTTAGCTATTTCT         GGGTGACCCAGTCTAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  61494 GGAAAATGGGTAGTTAGCTATTTCTGTA...TAGGGGTGACCCAGTCTAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 TAAAGAAAGAAAAATGCTGAATGAG         CATGATTTTGAAGTCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  62035 TAAAGAAAGAAAAATGCTGAATGAGGTA...CAGCATGATTTTGAAGTCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 GAGGAGATGTGGTCAATGGAAGAAACCACCAAGGTCCAAAGCGAGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  68273 GAGGAGATGTGGTCAATGGAAGAAACCACCAAGGTCCAAAGCGAGCAAGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GAATCCCAGGACAGAAAG         ATCTTCAGGGGGCTAGAAATCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  68323 GAATCCCAGGACAGAAAGGTA...CAGATCTTCAGGGGGCTAGAAATCTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 TTGCTATGGGCCCTTCACCAACATGCCCACAG         ATCAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  74298 TTGCTATGGGCCCTTCACCAACATGCCCACAGGTA...TAGATCAACTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 AATGGATGGTACAGCTGTGTGGTGCTTCTGTGGTGAAGGAGCTTTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  76207 AATGGATGGTACAGCTGTGTGGTGCTTCTGTGGTGAAGGAGCTTTCATCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 TTCACCCTTGGCACA         GGTGTCCACCCAATTGTGGTTGTGCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
  76257 TTCACCCTTGGCACAGTA...CAGGGTGTCCACCCAATTGTGGTTGTGCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 GCCAGATGCCTGGACAGAGGACAATGGCTTCCATG         CAATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  77715 GCCAGATGCCTGGACAGAGGACAATGGCTTCCATGGTA...CAGCAATTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2303 GGCAGATGTGTGAGGCACCTGTGGTGACCCGAGAGTGGGTGTTGGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79596 GGCAGATGTGTGAGGCACCTGTGGTGACCCGAGAGTGGGTGTTGGACAGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 GTAGCACTCTACCAGTGCCAGGAGCTGGACACCTACCTGATACCCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79646 GTAGCACTCTACCAGTGCCAGGAGCTGGACACCTACCTGATACCCCAGAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 CCCCCACAGCCACTACTGACTGCAGCCAGCCACAGGTACAGAGCCAC GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||
  79696 CCCCCACAGCCACTACTGACTGCAGCCAGCCACAGGTACAGAGCCACAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 ACCCCAAGAATGAGCTTACAAAGTGGCCTTTCCAGGCCCTGGGAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79746 ACCCCAAGAATGAGCTTACAAAGTGGCCTTTCCAGGCCCTGGGAGCTCCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2502 CTCACTCTTCAGTCCTTCTACTGTCCTGGCTACTAAATATTTTATGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79796 CTCACTCTTCAGTCCTTCTACTGTCCTGGCTACTAAATATTTTATGTACA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 TCAGCCTGAAAAGGACTTCTGGCTATGCAAGGGTCCCTTAAAGATTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79846 TCAGCCTGAAAAGGACTTCTGGCTATGCAAGGGTCCCTTAAAGATTTTCT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 GCTTGAAGTCTCCCTTGGAAATCTGCCATGAGCACAAAATTATGGTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79896 GCTTGAAGTCTCCCTTGGAAATCTGCCATGAGCACAAAATTATGGTAATT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 TTTCACCTGAGAAGATTTTAAAACCATTTAAACGCCACCAATTGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79946 TTTCACCTGAGAAGATTTTAAAACCATTTAAACGCCACCAATTGAGCAAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 ATGCTGATTCATTATTTATCAGCCCTATTCTTTCTATTCAGGCTGTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79996 ATGCTGATTCATTATTTATCAGCCCTATTCTTTCTATTCAGGCTGTTGTT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 GGCTTAGGGCTGGAAGCACAGAGTGGCTTGGCCTCAAGAGAATAGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80046 GGCTTAGGGCTGGAAGCACAGAGTGGCTTGGCCTCAAGAGAATAGCTGGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2802 TTCCCTAAGTTTACTTCTCTAAAACCCTGTGTTCACAAAGGCAGAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80096 TTCCCTAAGTTTACTTCTCTAAAACCCTGTGTTCACAAAGGCAGAGAGTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2852 AGACCCTTCAATGGAAGGAGAGTGCTTGGGATCGATTATGTGACTTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80146 AGACCCTTCAATGGAAGGAGAGTGCTTGGGATCGATTATGTGACTTAAAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2902 TCAGAATAGTCCTTGGGCAGTTCTCAAATGTTGGAGTGGAACATTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80196 TCAGAATAGTCCTTGGGCAGTTCTCAAATGTTGGAGTGGAACATTGGGGA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2952 GGAAATTCTGAGGCAGGTATTAGAAATGAAAAGGAAACTTGAAACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80246 GGAAATTCTGAGGCAGGTATTAGAAATGAAAAGGAAACTTGAAACCTGGG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3002 CATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80296 CATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3052 AGATCACTGGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80346 AGATCACTGGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3102 CCCCATCTCTACTAAAAATACAGAAATTAGCCGGTCATGGTGGTGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80396 CCCCATCTCTACTAAAAATACAGAAATTAGCCGGTCATGGTGGTGGACAC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3152 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGTGGCTAAGGCAGGAGAATCACTTCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80446 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGTGGCTAAGGCAGGAGAATCACTTCAGCCC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3202 GGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATACCACGGCACTCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80496 GGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATACCACGGCACTCCAGCCT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3252 GGGTGACAGTGAGACTGTGGCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA GGAAAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||
  80546 GGGTGACAGTGAGACTGTGGCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAATG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3301 AAACTAGGAAAGGTTTCTTAAAGTCTGAGATATATTTGCTAGATTTCTAA
        ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  80596 AAACTAGAAGAGATTTCTAAAAGTCTGAGATATATTTGCTAGATTTCTAA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3351 AGAATGTGTTCTAAAACAGCAGAAGATTTTCAAGAACCGGTTTCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80646 AGAATGTGTTCTAAAACAGCAGAAGATTTTCAAGAACCGGTTTCCAAAGA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3401 CAGTCTTCTAATTCCTCATTAGTAATAAGTAAAATGTTTATTGTTGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80696 CAGTCTTCTAATTCCTCATTAGTAATAAGTAAAATGTTTATTGTTGTAGC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3451 TCTGGTATATAATCCATTCCTCTTAAAATATAAGACCTCTGGCATGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80746 TCTGGTATATAATCCATTCCTCTTAAAATATAAGACCTCTGGCATGAATA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3501 TTTCATATCTATAAAATGACAGATCCCACCAGGAAGGAAGCTGTTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80796 TTTCATATCTATAAAATGACAGATCCCACCAGGAAGGAAGCTGTTGCTTT

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3551 CTTTGAGGTGATTTTTTTCCTTTGCTCCCTGTTGCTGAAACCATACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80846 CTTTGAGGTGATTTTTTTCCTTTGCTCCCTGTTGCTGAAACCATACAGCT

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3601 TCATAAATAATTTTGCTTGCTGAAGGAAGAAAAAGTGTTTTTCATAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80896 TCATAAATAATTTTGCTTGCTGAAGGAAGAAAAAGTGTTTTTCATAAACC

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3651 CATTATCCAGGACTGTTTATAGCTGTTGGAAGGACTAGGTCTTCCCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80946 CATTATCCAGGACTGTTTATAGCTGTTGGAAGGACTAGGTCTTCCCTAGC

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3701 CCCCCCAGTGTGCAAGGGCAGTGAAGACTTGATTGTACAAAATACGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80996 CCCCCCAGTGTGCAAGGGCAGTGAAGACTTGATTGTACAAAATACGTTTT

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3751 GTAAATGTTGTGCTGTTAACACTGCAAATAAACTTGGTAGCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  81046 GTAAATGTTGTGCTGTTAACACTGCAAATAAACTTGGTAGCAAACA

END